O LabCidade é financiado a partir de bolsas de pesquisa e financiamentos de instituições. A Fundação Ford no Brasil é, atualmente, a principal financiadora dos projetos que são desenvolvidos no laboratório, sendo eles: a pesquisa “Territórios populares: Reestruturação territorial, desigualdades e resistências nas metrópoles brasileiras“, do observaSP, realizada em parceria com os grupos de pesquisa Lugar Comum (UFBA), PRAXIS (UFMG) e indisciplinar (UFMG), e que inclui a manutenção do blog observaSP; e a pesquisa “Despejos, remoções e resistências nos territórios populares“, do Observatório de Remoções, realizada em parceria com LabJuta (UFABC), PRAXIS (UFMG) e Lehab (UFC). Os pesquisadores do laboratório também são financiados por bolsas da Fundação de Apoio à Universidade de São Paulo (FUSP).